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基于deBruijn图的肽序列组装方法和装置

发布时间：2022-10-31

基本信息

  • 合作方式: 技术转让
  • 成果类型:
价格 双方协商

行业领域

高新技术改造传统产业

成果描述

本发明提供一种基于deBruijn图的肽序列组装方法和装置,所述方法包括以下步骤:获取轻重链序列数据,并使用所述轻重链序列数据创建序列比对数据库;将肽序列测试数据进行k mer处理,得到k mer序列集合;将所述k mer序列集合与所述序列比对数据库进行比对,得到比对得分;若所述k mer序列集合中是轻重链混合数据,则将所述比对得分分为轻链和重链两类,分别构建deBruijn图,若所述k mer序列集合是轻链或者重链数据,则直接构建deBruijn图;在所述deBruijn图中进行序列组装,得到组装好的肽序列。本发明能够将肽序列片段在区分轻重链的条件下进行肽序列组装,组装效率有了很大的提高,组装结果有效可靠。

成果资料