走出实验室 国产新型基因测序平台从研发到落地
发布时间: 2022-05-30
本报讯(融媒体中心记者 孙艳平)“基于全自主研发的国产测序平台,我们希望为构建中国技术主导的测序新生态夯实地基。” 赛纳生物科技(北京)有限公司(简称:赛纳生物)联合创始人、CEO陈子天博士说。小小的国产平台背后,是从技术源头创新,是三代科技工作者的初心传承;从实验室到产业化,道虽远,行则将至。
2010年,随着国际基因测序商业的发展,高通量测序仪在中国萌芽,但高额利润和技术被上游外国测序仪企业垄断,国内基因测序公司处在金字塔中下游。如何改变?从哈佛全职回到北京大学的谢晓亮院士,带领黄岩谊教授课题组一起,启动了国产原创基因测序仪的系统性研发课题。作为国家基因测序仪863重大项目的首席科学家团队,他们组建起一支年轻的研发团队,陈子天逐渐成为这个团队的核心成员。
自主研发道阻且长,没有人知道能否找到底层技术的新突破。外界测序技术在商业化推动下飞速进步,陈子天憋着一股劲儿,全身心投入实验中。有一天,实验要测试一种新合成的荧光碱基反应性能,他灵光一闪:如果一次混着加入几种碱基,不就能看到连续反应动力学性能了吗?这种“混合”信号能不能被解码?他查阅资料发现,信息传输领域的解码技术完全具备这种可行性,立刻兴奋地和导师讨论并着手实验,创造出纠错编码(ECC)测序策略,即“2+2”编码纠错测序原理:不再单个识别碱基,而是两两组合测序,这样三轮信息经由算法进行纠错和校正,可获得极为精确的碱基序列。至此,这项技术真正成为有完整自主知识产权的中国技术。
技术难题攻克了,如何将技术转化为产品?“实验室只能进行原理性验证,要想做成真正的产品,必须遵循商业化产品的开发逻辑。”陈子天说。2015年,依托国际首创的荧光发生(Fluorogenic)测序纠错编码和纠错编码(ECC)测序策略这两项核心技术,陈子天联合谢晓亮院士、黄岩谊教授团队创立了赛纳生物。
“从实验室到工程化探索,最大的挑战来自于原研技术没有可参照的工程设计。”陈子天说。光学系统设计、测序化学、芯片设计、算法等多个关键技术难点相互耦合在一起,全部要靠团队自己同步开发,反复迭代。2017年,陈子天带领团队设计出赛纳生物第一代基因测序仪原型机,进行了首次真正的高通量测序。随后,经多次迭代,他们推出各项性能稳定的工程机,目前已实现产品量产,并启动医疗器械临床注册。
2022年,赛纳生物迎来“商业化元年”,拥有全自主知识产权的国产基因测序仪S100和配套测序芯片、试剂已于今年1月正式发布。陈子天说:“基因技术产业已被国家列为战略性新兴产业,赛纳生物将不断探索,持续推动高通量测序技术更广泛的应用,用高标准助力我国测序产业快速发展。”
图文来源:亦诚时报

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