排水分中心隶属于内蒙古河套灌区水利发展中心，属公益性一类事业单位，正处级建制，按照市政府的机构改革方案，根据《关于内蒙古河套灌区水利发展中心排水分中心机构职能编制的批复》要求，排水分中心贯彻落实党中央关于河套灌区治水决策和自治区党委、市委决策部署，承担总排干水利发展建设相关工作。主要职责是：承担着总排干沟工程管理、排水运行、水质监测与保护、再生水利用、乌梁素海生态补水和指导协调灌区排水工作等工作职能。 总排干沟由主干段、乌梁素海段、出口段三部分组成，第一部分是从杭锦后旗到乌梁素海的主干段，长约200 km；第二部分依靠乌梁素海的天然水面，长30km；第三部分从乌梁素海南端泄水闸开始，到三湖河口入黄河处，称为出口工程，长约24km。总排干沟沿线有直口排沟124条，各类水工建筑物316座。直接管理排水泵站11座。其中，红站最大排水能力120M３/S，近十年年均排水量5.7亿M3。 总排干沟主要功能是排泄整个灌区地下水、灌溉余水及山洪水，降低地下水位，排盐治碱，改良土壤，不仅是灌区农业排水、沿山山洪排水大通道，也是全市七个旗县区工业、城镇排水的重要组成部分，年排水量4-5亿立方米，从1975年打通运行40多年来，通过总排干沟累计排入乌梁素海水量230亿立方米，排盐3822万吨，通过乌梁素海出口排入黄河水量106亿立方米，排盐2698万吨。不仅为控制灌区地下水位，调节水盐动态平衡、防治土壤盐碱化、改善土地质量发挥了至关重要的作用，也为全市农业增产、农民增收、农村稳定和河套地区的防洪排涝做出了巨大贡献。2014年之后，总排干沟又承担起了为乌梁素海实施生态补水、改善水生态环境的重要职能，至2020年生态补水约28亿立方米，其中2019年生态补水6.15亿立方米，为历史上排水最大的年份。为保障全市工业城镇排水安全和乌梁素海及灌区水生态环境改善发挥着不可替代的重要作用。