西宁市湟中区卫生健康局共设医政科、爱卫办、计生办等8个科室，下设卫生计生综合行政执法大队。全区共有各级各类医疗卫生机构676家，其中区级综合医院2家、专科医院2家、公共卫生服务机构2家、民营医院2家、乡镇卫生院16家、村卫生室573家（其中盈利性村卫生室157家）、诊所62家、卫生所7家，其他10家（佑安慈善医院、丹麻卫生院、上五庄卫生院门诊、门诊部2家、卫生站2家、医务室2家、门诊1家），全区各行政村标准化村卫生室覆盖率达100%。