学会主办的学术期刊有《中国生物医学工程学报》、《ChineseJournalofBiomedicalEngineering》、《中国心脏起搏与电生理杂志》、《中国血液流变学杂志》,其中《中国生物医学工程学报》长期入选中国科学引文数据库(CSCD)、北京大学中文核心期刊和中国科技核心期刊(CJCR),CJCR影响因子一直居本领域排名前列。未来,中国生物医学工程学会将围绕“强能力、增内涵、建机制”三主旨,树立品牌,构建专业智库,健全创新机制,加强文化建设,引领学科发展方向,增强国际交流与合作能力,建设具有重要国际影响力的一流科技社团。