三亚南京农业大学研究院是南京农业大学根据《三亚市人民政府、南京农业大学、南繁科技城有限公司战略合作框架协议》设立的具有独立法人资格的事业单位。是对接海南经济特色和产业发展需求，培养高层次涉农人才，集教学、科研和成果转化于一体的创新创业研究院。教育部2021年批复我院海南专项招生博士5名硕士20名。我院已有作物遗传与种质创新、设施农业高效生产、农业昆虫与病害虫防治等科研团队。现有农作物分子育种、作物基因编辑、特色园艺作物种质创新、农作物病虫害防治、农业废弃物资源化利用与新型肥料6个功能实验室。