基于群体低乘数测序数据的基因组变异高效鉴定软件

发布时间: 2023-10-30

来源: 科技服务团

截止日期:2023-10-30

价格双方协商

地区：山东省潍坊市高新区

需求方：山东***公司

行业领域

电子信息技术,农、林、牧、渔业,软件,农业

需求背景

解析不同遗传背景材料之间的基因型相关性、相似性等数据时需要分析多类数据，处理起来非常复杂，如果能够开发一款数据处理系统就能够大大减轻工作量。能够通过获得番茄测序材料之间的表型相关性、相似性和聚类模式，以及它们与基因型信息之间的关联特征。这些信息可以帮助我们更好地理解番茄的遗传背景和表型特征。

需解决的主要技术难题

通过系统将分析结论可以更直观的观察，系统需要利用SPSS计算标准差、方差和协方差进行PCA分析，将最终计算出的结果通过图形化的形式呈现，这样利于观察其特征信息。

期望实现的主要技术目标

a、能够实现表型相关性分析、表型主成分分析、表型聚类等

b、能够完成PCA分析、聚类分析等

c、可以利用图表形式表现出结果。

需求解析

解析单位：“科创中国”蔬菜数字种植产业科技服务团（中国园艺学会） 解析时间：2023-11-01

杨坤

中国农业科学院蔬菜花卉研究所

课题组长、常务副主任/正高级农艺师

综合评价

此需求的描述清晰，需求所涉的技术具有可行性，技术指标设计的合理清晰。为了提升鉴定鉴定过程的工作效率，开发基于群体低乘数测序数据的基因组变异高效鉴定软件是有必要的。在设计软件时需要明确项目的目标、项目的范围。还要注重软件应具备准确的检测能力和分析的能力，需要减少误报和漏报现象的发生。

处理进度

服务方

科创中国