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报告题目：Deciphering spatial domains from spatially resolved transcriptomics
报告人：张世华（中国科学院数学与系统科学研究院）
报告时间：2022年5月23日下午4:00-5:00
报告形式：腾讯会议ID：468-751-569
内容简介：***, we developed a graph attention auto- encoder framework STAGATE to accurately identify spatial domains by learning low-***, STAGATE adopts an attention mechanism to adaptively learn the similarity of neighboring spots, and an optional cell type-aware module through integrating the pre-***, ***, STAGATE could be extended to multiple consecutive sections for reducing batch effects between sections and extracting 3D expression domains from the reconstructed 3D tissue effectively.
报告人简介： 张世华，中国科学院数学与系统科学研究院研究员、中国科学院随机复杂结构与数据科学重点实验室副主任、中国科学院大学岗位教授。主要从事生物信息计算、机器智能与优化交叉研究，主要成果发表在Cell、Nature Communications、Advanced Science、Cell Reports、National Science Review、Science Bulletin、Nucleic Acids Research、IEEE TPAMI、IEEE TKDE、IEEE TNNLS等杂志。曾荣获全国百篇优秀博士论文奖（2010）、中国青年科技奖（2013）、中国科学院卢嘉锡青年人才奖（2013）、国家自然科学基金优秀青年基金（2014）等。成果入选2021年度中国生物信息学十大进展、2019年度中国生物信息学十大算法和工具。
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