科创中国
基于SNP数据的预测方法、装置、设备及存储介质
成果类型：: 发明专利
发布时间: 2023-09-14 16:39:16
科技成果产业化落地方案
方案提交机构：天津市滨海新区| 宋学姮 | 2023-10-07 10:46:59
本申请公开了一种基于SNP数据的预测方法、装置、设备及可读存储介质，该方法包括步骤：获取被试者的SNP数据；将所述SNP数据中的SNP位点数据输入至预设预测模型，基于所述预设预测模型，对所述SNP位点数据进行预测处理，输出目标预测结果。本申请增加了对被试者数据分析后，得到的AD预测结果的准确性。
权利要求
1.一种基于SNP数据的预测方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：
获取被试者的SNP数据；
将所述SNP数据中的SNP位点数据输入至预设预测模型，基于所述预设预测模型，对所述SNP位点数据进行预测处理，输出目标预测结果。
2.如权利要求1所述的基于SNP数据的预测方法，其特征在于，所述将所述SNP数据中的SNP位点数据输入至预设预测模型，基于所述预设预测模型，对所述SNP位点数据进行预测处理，输出目标预测结果的步骤之前，包括：
对所述SNP数据进行筛选，得到筛选后的第一筛选数据；
对所述第一筛选数据进行关联分析，得到关联数据；
将所述关联数据进行二次筛选，得到与AD相关联的SNP位点数据。
阿尔茨海默病（Alzheimer's disease, AD）是一种常见的进行性中枢神经系统退行性疾病，约占所有痴呆病例的60%-80%，现有研究表明，AD患者的大脑的萎缩通常发生在临床表现之前，可以基于单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism, SNP）检测的方式来寻找影响AD的易感基因及其风险位点，从而预测患者发展为AD的风险，进一步提高AD早期干预的效果。
相关技术中，基于单核苷酸多态性来诊断AD的技术大多使用传统的全基因组关联分析（Genome wide association study, GWAS）方法，通过该方法基于相关性分析得到的P值，从而确定与AD相关的风险位点，但仅使用相关性分析容易忽略那些在统计分析上不显著，通过共同作用影响疾病的位点，从而导致得出的AD预测结果不准确。
中国科学院深圳先进技术研究院提升了粤港地区及我国先进制造业和现代服务业的自主创新能力，推动我国自主知识产权新工业的建立，成为国际一流的工业研究院。 深圳先进院目前已初步构建了以科研为主的集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统，由九个研究平台，国科大深圳先进技术学院，多个特色产业育成基地、多支产业发展基金、多个具有独立法人资质的新型专业科研机构等组成。开展先进技术研究，促进科技发展。信息、电子、通讯技术研究新材料、新能源技术研究高性能计算、自动化、精密机械研究生物医学与医疗仪器研究相关学历教育、博士后培养与学术交流。
本申请提供了一种基于SNP数据的预测方法、装置、设备及存储介质，与相关技术中，对患者的数据进行相关性分析，得到的AD预测结果不准确的方式相比，在本申请中，获取被试者的SNP数据；将所述SNP数据中的SNP位点数据输入至预设预测模型，基于所述预设预测模型，对所述SNP位点数据进行预测处理，输出目标预测结果。在本申请中，可以理解的是，通过获取被试者的SNP数据，并将SNP数据中的SNP位点数据输入至预设预测模型，根据预设预测模型对相应的SNP位点数据进行处理，得到SNP位点数据的特征信息，可以根据SNP位点数据进行对被试者发展为AD的风险进行预测，得到预测结果，相对于相关性分析，经过预设预测模型分析得到的目标预测结果可解释性更强，提升了预测结果的准确性，从而可以在早期评估患者发展为AD的风险。
技术合作
通过以上的实施方式的描述，本领域的技术人员可以清楚地了解到上述实施例方法可借助软件加必需的通用硬件平台的方式来实现，当然也可以通过硬件，但很多情况下前者是更佳的实施方式。基于这样的理解，本申请的技术方案本质上或者说对现有技术做出贡献的部分可以以软件产品的形式体现出来，该计算机软件产品存储在如上所述的一个存储介质(如ROM/RAM、磁碟、光盘)中，包括若干指令用以使得一台终端设备(可以是手机，计算机，服务器，空调器，或者网络设备等)执行本申请各个实施例所述的方法。
以上仅为本申请的优选实施例，并非因此限制本申请的专利范围，凡是利用本申请说明书及附图内容所作的等效结构或等效流程变换，或直接或间接运用在其他相关的技术领域，均同理包括在本申请的专利保护范围内。
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