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一种基于随机变分贝叶斯的基因调控网络拓扑结构识别方法、系统及存储介质

成果类型:: 发明专利,新技术

发布时间: 2023-07-18 17:56:17

科技成果产业化落地方案
方案提交机构:重庆市高新区| 陈点 | 2023-07-19 09:43:33

本发明涉及生物基因表达技术领域,特别是一种基于随机变分贝叶斯的基因调控网络拓扑结构识别方法、系统及存储介质。步骤为:1)获取待识别基因表达数据集;2)采用基于状态空间模型的动态结构函数DSF建模重构基因调控网络模型;3)采用基于随机变分贝叶斯的方法对基因调控网络模型中的参数进行估计;

步骤为:1)获取待识别基因表达数据集;2)采用基于状态空间模型的动态结构函数DSF建模重构基因调控网络模型;3)采用基于随机变分贝叶斯的方法对基因调控网络模型中的参数进行估计;4)采用前向选择方法对基因调控网络的拓扑结构进行识别,用ARD变量来更新网络模型,并使用下界函数J选择模型结构,绘制基因调控网络拓扑图。本发明利用基于部分数据的自然梯度,对全局变量的后验分布进行了更新,其计算成本远低于经典VI方法,适用于基因调控网络拓扑结构的识别。

涉及生物基因表达技术领域,特别是一种基于随机变分贝叶斯的基因调控网络拓扑结构识别方法、系统及存储介质。获取待识别基因表达数据集;2)采用基于状态空间模型的动态结构函数DSF建模重构基因调控网络模型;

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并使用下界函数J选择模型结构,绘制基因调控网络拓扑图。本发明利用基于部分数据的自然梯度,对全局变量的后验分布进行了更新,其计算成本远低于经典VI方法,适用于基因调控网络拓扑结构的识别。

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