科创中国
一种与肝癌相关的非编码RNA生物标志物及其应用
成果类型：: 发明专利
发布时间: 2022-11-17 19:01:24
科技成果产业化落地方案
方案提交机构：成果发布人| 欧阳文慧 | 2022-11-17 19:01:25
体液无创检测作为一门新型的检测技术，越来越受到关注。目前可以作为无创检测的生物标志物大多数蛋白质分子和DNA分子，但这些标志物在灵敏度、误诊率和经济成本上的缺陷导致它们很难被普及。RNA分子在细胞中拥有多个拷贝并且存在多种转录调控形态，可以更加准确地反映细胞状态和癌症动态发展过程。大规模体液RNA表达谱测定可以提供基因组差异表达和转录组动态变化的双重信息，因此在疾病发生发展过程中可以做为一种更有优势的分子标志物，具有更大的科研价值和临床应用前景。体液中游离RNA(extracellular RNA,exRNA)除了mRNA片段，还有多种非编码RNA：之前关于exRNA生物标志物的研究大都关注于miRNA，随着二代测序技术的发展，其他类型的非编码RNA作为分子标志物的的潜能也被发掘。血液中的非编码RNA(ncRNA)可以自身形成二级结构，或者和RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBP)结合，从而可以稳定存在于血液中，因此可以作为体液无创检测的分子标志物。
确定待测对象是否为肝癌患者的方法如下：如果所述待测对象的血浆中S结构域片段的含量大于5.7amol/微升血浆，所述待测对象为或候选为肝癌患者，如果所述待测测对象的血浆中S结构域片段的含量小于或等于5.7amol/微升血浆，所述待测对象为或候选为非肝癌患者。灵敏度和特异度高，可以用于制备肝癌临床诊断试剂盒。
本项目首先构建了一套完整且可靠地血浆RNA提取、建库及数据分析方法，通过差异表达分析及RT-qPCR独立验证的方法找到了可以用于肝癌早期诊断及预后的新型标志物 （非编码RNA分子的稳定结构域），可应用于开发高敏感度及特异性的肝癌血浆早期检测试剂盒，应用前景广阔。
本项目负责人为清华大学生命科学学院研究员、博士生导师，教育部“青年长江学者”，国家基金委“优秀青年”基金获得者，主要从事生物信息学研究的方向，并探索能够广泛应用于基因组学和癌症生物学的临床实践。在国际权威期刊上发表SCI论文~60篇，申请专利多项。团队核心成员：鲁志，教授，鲁志实验室致力于发展生物信息学技术，并探索能够广泛应用于动植物基因组学和癌症生物学的具体实践。我们利用高通量测序，结合机器学习和人工智能技术，来研究遗传信息是如何被编码在结构化的DNA和RNA分子之中，以及它们是如何在一个生命体系中相互作用、彼此调控。团队核心成员：曹静怡，博士，鲁志实验室研究员，从事动植物中编码和非编码RNA的转录后调控研究。团队核心成员：谈畅，博士，鲁志实验室研究员，从事生物信息与结构生物学的研究。
本项目已申请国内专利两项，已获得授权，专利归清华大学单独持有，项目成果与肝癌相关的非编码RNA生物标志物可以用于诊断肝癌，灵敏度和特异度高，可以用来制备肝癌临床诊断试剂盒，还可以用于筛选人类肝癌药物的治疗靶点，将产生极大的市场效益。
本项目接受转移转化，合作方式：专利许可/合作开发/作价投资。
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