科创中国

生物与新医药技术,高技术服务业,高新技术改造传统产业,生物产业,农、林、牧、渔业

副格氏乳杆菌(Lactobacillus paragasseri)作为格式乳杆菌(Lactobacillus gasseri)的近源物种,是肠道、生殖道重要菌种之一。本成果采用Nanopore和Illumina两种测序技术完成了 IMAU FB017全基因组测序及完成图组装,并结合NCBI已公开的18株L.paragasseri基因组序列进行比较基因组学分析.利用Roary软件识别核心基因集与泛基因集;采用 Rapid Annotation using Subsystem Technology(RAST)网站对基因组进行功能注释,以探究 IMAU FB017基因组特征。

本成果的亮点在于研究表明IMAU FB017基因组包含1条环状染色体和1个质粒,其中环状染色体大小为1 880 023 bp,GC含量为34.90％,包含1 851个蛋白质编码区(protein-coding sequence,CDS);质粒大小 43 639 bp,GC 含量为 38.00％.基于 18 株 L.paragasseri 基因组序列识别到的903个核心基因构建系统发育树,发现L.paragasseri群体共形成3个分支.菌株IMAU FB017属于分支I,该分支包含菌株最多(13株,约占68％),且相同分离源的菌株无显著聚集趋势.功能注释分析发现,IMAU FB017基因组中编码关于N-乙酰半乳糖胺和半乳糖胺的利用相关基因以及草酸分解代谢相关益生基因,并且包含1条完整的胞外多糖(exopolysaccharides,eps)基因簇和3条耐酸耐胆盐相关基因簇且与表型对应。本研究从基因组水平解析了 IMAU FB017遗传背景,并挖掘了潜在益生相关基因,为其开发利用提供参考。

内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室围绕乳酸菌与发酵乳制品承担了国家自然基金重点项目、农业部公益性行业科研专项、国家重点研发计划和自治区科技重大专项等科研任务。建立了亚洲最大的乳酸菌菌种资源库，创立优良菌株筛选技术和评价体系，攻克乳酸菌高密度发酵等产业化关键技术，实现了乳酸菌发酵剂的国产化，获得何梁何利科技创新奖、国家科技进步二等奖（排名第4）、教育部高等学校技术发明一等奖、内蒙古自然科学一等奖等省部级奖项12项，发表SCI论文268篇、授权发明专利38件、制定食品安全地方标准12项、主编专著15部，取得了显著的经济和社会效益。 团队的研究领域及方向：1.乳酸菌生物多样性；2.乳酸菌功能基因组；3.乳酸菌资源开发与利用；4.肠道微生物

点击查看