确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法及设备

发布时间: 2023-09-14

来源: 科技服务团

基本信息

合作方式：技术转让

成果类型：发明专利

行业领域：

生物与新医药技术

成果介绍

本发明实施例提供了一种确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法及设备。其中，所述方法包括：采用第二代高通量测序，获取菌群样本中所有菌种的标记基因序列，对所述标记基因序列进行分析，得到所述菌种的可操作分类单元，并采用R语言对所述可操作分类单元进行可视化；根据所述菌种的可操作分类单元，对所述菌群样本进行差异性分析，得到所述菌群样本的菌群结构，结合半封闭环境特征参数，确定所述菌群结构和菌群功能，与环境因素的相关性。本发明实施例提供的确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法及设备，可以较为精确的确定环境因素与菌群结构和功能的相关性。

成果亮点

凭借着高通量测序的便利，高性能计算的高速发展带来的大数据时代，“人类?微生物?环境”相互作用网络的得到一定程度的完善然而影响微生物群落的因素多种多样，现有的问题导向的科学研究常常集中研究某一个或者少数几个点，针对半封闭环境的微生物系统化纵向分析鲜见报道。本成果提供了一种确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法及设备，有效弥补现有技术存在的上述技术空白。

团队介绍

宁康教师团队研究方向为生物信息学、生物大数据挖掘、以及相关方法在微生物组学研究中的应用。研究重点包括：（1）创新性的微生物组学实验和数据分析，（2）微生物组学数据库系统的开发，（3）基于微生物组学大数据的群落宏基因组信息挖掘，（4）单细胞数据分析方法开发和应用，（5）蛋白组和调控网络等数据分析，（6）大数据分析算法和高性能计算等。

成果资料

产业化落地方案

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成果综合评价报告

评价单位：“科创中国”医疗康养产业科技服务团 (中国生物工程学会) 评价时间：2023-10-12

陈修来

江南大学

教授

综合评价

该成果技术路径清晰，新开发的确定环境因素与菌群结构和功能相关性的方法及设备，为半封闭环境与菌群结构和菌群功能相关性的确定提供了新思路，对于微生物群落的综合开发利用具有非常重要的意义。建议加大推广力度，尽快转化，完成后续设备有效性评价，推动产品尽快上市，为微生物群落的研究和开发应用奠定基础。

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