科创中国
基于stacking集成学习策略的Cas蛋白预测方法
发布时间: 2023-07-27
基本信息
合作方式：
技术转让
成果类型：
发明专利
行业领域：
生物与新医药技术
成果介绍
CRISPR-Cas系统是大多数细菌与古菌中用于抵御病毒的一种免疫系统。在不断探究CRISPR-Cas系统及其功能多样性的相关研究中最关键的步骤之一是鉴定CRISPR-Cas系统中的Cas蛋白。在过去的10年里，随着科学家们对CRISPR-Cas系统的深入理解，目前已在细菌和古细菌基因组中鉴定得到了与CRISPR-Cas系统相关的不同蛋白家族至少45个。由RNA引导的DNA内切酶，如Cas9和c2c2等Cas蛋白，越来越多的被应用于基因组编辑领域。
成果亮点
基于CRISPR进行病毒诊断的相关研究也不断兴起，但与基因编辑领域常用Cas9不同的是，基于CRISPR的诊断研究中常用Cas13这一家族。有效识别更多的Cas蛋白不仅是帮助生物学家进一步推断CRISPR-Cas系统类型，理解CRISPR-Cas系统机制的必要条件，也是支持基因编辑新型剪子和基于CRISPR的病毒诊断研究等新型技术发展的起点。目前为止，已经开发了一些基于机器学习的方法来识别Cas蛋白，但其在模型构建及特征工程方面存在着一定的局限性，导致无法达到理想的预测效果。
团队介绍
学校创建于1952年7月，原名东北林学院，是在浙江大学农学院森林系和东北农学院森林系基础上建立的，由国家林业部直属管理。1985年8月更名为东北林业大学。2000年2月，由国家林业局划归教育部直属管理。2005年10月，经国家发改委、财政部和教育部批准，成为国家“211工程”重点建设高校。2010年11月，教育部和国家林业局签署合作共建协议。2011年6月，成为国家“优势学科创新平台”项目重点建设高校。2012年3月，教育部与黑龙江省人民政府签署合作共建协议。2017年9月，经国务院批准列为“双一流”建设高校。2022年2月，入选国家第二轮“双一流”建设高校。
成果资料
产业化落地方案
成果综合评价报告
评价单位：“科创中国”黑龙江科技服务团 (黑龙江省科学技术协会) 评价时间：2023-10-24
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