科创中国
一种土壤细菌数量的精确提取方法
发布时间: 2022-12-09
来源: 科技服务团
基本信息
合作方式：
技术转让
成果类型：
发明专利
行业领域：
生物与新医药技术
成果介绍
本发明提供一种土壤细菌数量的精确提取方法，解决了现有的细菌数量目视提取过程费时费力，且难以实现重复性的测量和提取等一系列的操作和技术问题。获取标准土壤细菌培养皿发育图像，对土壤细菌图像进行标准化预处理，确定细菌图像单个像素实际尺度，对标准化预处理和裁剪后的细菌图像进行统一的图像增强，对图像的像元建立统计直方图并根据直方图结果分割系数，对图像进行二值化处理，利用分水岭算法将图像中细菌体进行分割使其变成独立个体，然后对图像进行连通区域的标注，最后通过标记矩阵对每个细菌体进行提取。本发明涉及的方法可以实现同时对细菌图像的批量处理，能够大幅提高土壤细菌数量的提取效率。
成果亮点
要提取不同尺寸范围的土壤细菌数量，按照下列方法确定提取面积范围的计算标准：设置土壤细菌尺寸参数范围q1毫米和q2毫米作为想要提取细菌的尺寸边界，提取细菌尺寸在q1毫米和q2毫米之间的细菌数量，首先确定细菌最小尺寸q1毫米和最大尺寸q2毫米之间分别对应的像元大小Q1和Q2就分别为Q1＝q1/C和Q2＝q2/C，则利用MATLAB软件的膨胀腐蚀算法先将所有面积小于Q1个像元的单个细菌体作为噪声点去除，并将图像结果保存为R1，再将所有面积小于Q2个像元的单个细菌体作为噪声点去除并将结果保存为R2，那么对图像R1减R2的处理结果R’＝R1-R2就是实际单个细菌尺寸大小Q在q1≤Q≤q2之间的所有细菌图像，
要提取该范围内的所有细菌数量，直接对R’图像进行8连通区域的标注并计算标记矩阵，最后通过标记矩阵对每个细菌体进行提取。
团队介绍
雷锋团队是由哈尔滨师范大学14级政治与行政学院的关明贺同学于2015年9月1日建立的学生自主创立的创业团队。在黑龙江福成科技有限公司的赞助下，旨在为江北的大学生服务，让大学生过上更好的大学生活。自创立以来，雷锋团队本着为同学服务的宗旨，解决大学生生活问题为核心，为大学生提供广大的创业机会。创立后不久已成为哈尔滨江北十余所大学院校人数最多、最有号召力和影响力的学生团队组织。
成果资料
产业化落地方案
成果综合评价报告
评价单位：“科创中国”黑龙江科技服务团 (黑龙江省科学技术协会) 评价时间：2023-11-11
评价单位：“科创中国”黑龙江科技服务团 (黑龙江省科学技术协会) 评价时间：2022-12-10
袁国辉
哈尔滨工业大学
教授
综合评价
对标准化预处理和裁剪后的细菌图像进行统一的图像增强，对图像的像元建立统计直方图并根据直方图结果分割系数，对图像进行二值化处理，利用分水岭算法将图像中细菌体进行分割使其变成独立个体，然后对图像进行连通区域的标注，最后通过标记矩阵对每个细菌体进行提取。
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