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基于卷积神经网络的BRCA1基因变异的临床预测系统

发布时间: 2022-11-02

基本信息

合作方式: 技术转让
成果类型: 发明专利
行业领域:
生物与新医药技术
成果介绍
由于高通量测序的飞速发展,发现很多临床意义不明确的基因变异,为临床解读带来了极大的困扰。目前只有很少一部分基因变异具有明确的临床意义。因此,迫切需要建立能够对各种变异进行临床意义解读的模型。我们开发了基于AlphaFold2蛋白质三级结构的功能预测系统。首先采用卷积神经网络训练了一个名为PTSnet的模型,对BRCA1的基因变异的分类准确率达到89%,提高了临床解读的准确性。将来也可用于其他基因变异的临床解读,以及药物分子研发设计。
成果亮点
该模型对BRCA1的基因变异的分类准确率达到89%,提高了临床解读的准确性。将来也可用于其他基因变异的临床解读,以及药物分子研发设计。
团队介绍
本团队多年来在医院从事生物信息工作,具有较好的多学科交叉融合能力。团队简介分别具有临床检验、生物和计算机专业背景。近年来发表多篇高质量研究论著,在单细胞测序,肿瘤基因检测等方面做过大量的工作。承担国家十三五重点研发计划、国自然等多个课题,荣获北京医学会创新转化大赛优胜奖。
成果资料