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基于文献数据的儿童潜在药物不良反应信号挖掘及评价研究

发布时间: 2022-10-13

来源: 科技服务团

基本信息

合作方式: 技术转让
成果类型: 新技术
行业领域:
生物与新医药技术
成果介绍
药物不良反应(ADR) 是导致患者发病率,病死率升高以及公共卫生资源浪费的重要因素,是人类健康的一大负担,本研究预期能够构建基于文献摘要信息的儿童药物不良反应预测模型;形成儿童潜在物-不良反应筛选路径。可通过儿童患者进行相关因素的风险评估,从而达到预防不良反应的作用。
成果亮点
儿童药物不良反应预测模型构建 通过计算频词频-逆文本频数(termfrequency inverse document frequency,TF-IDF)提取文本特征。TF-IDF是文本挖掘中重要的方法之一词频是指某一特定词在某一文章中出现的频率;逆文本频率指文章总数除以含某一特定词的文档数的对数值;TF-IDF表示某一特定词在某一文章中的重要性。 (2)预测模型训练:随抽取部分样本作为训练集,对所选取的样本文本进行人工标注,标注为ADE 和Non-ADE 两类,若不能判定标注类别的文献删除。本研究采用Logistic回归、支持向量机和朴素贝叶斯分类方法训练药物不良反应分类预测模型,采用准确度、召回率、F1值评价模型,选择最优模型作为预测模型。利用构建的模型基于文摘数据进行药物不良反应预测,形成药物不良反应数据集。 潜在药物-不良反应筛选:对获得的药物不良反应数据集,依据Semantic MEDLINE和DrugBank 对药物适应症对过滤,并利用 SIDER 数据库和MedDRA 对常见的药物不良反应对进行标记和过滤,筛选潜在药物-不良反应。
团队介绍
1 华潞 320404197210100020 博士 正高级 中国医学科学院阜外医院 课题设计 2 吴艳 370102198002220823 博士 副高级 中国医学科学院阜外医院 质量控制 3 高鑫 210103197301025734 博士 副高级 中国医学科学院阜外医院 质量控制 4 郭婷婷 372526198405040047 硕士 中级 中国医学科学院阜外医院 数据收集 5 贾镭 620102198212271129 博士 副高级 中国医学科学院阜外医院 数据收集 6 严欣欣 440681198503221024 硕士 中级 中国医学科学院阜外医院 数据收集 7 彭富华 35082119870323333X 硕士 初级 中国医学科学院阜外医院 数据收集 8 谭江山 422823199410031133 学士 研究生 中国医学科学院阜外医院 统计分析 9 胡崧 612525199609100150 学士 研究生 中国医学科学院阜外医院 论文书写
成果资料
产业化落地方案
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成果综合评价报告

评价单位:“科创中国”生命科学与健康产业科技服务团 (中国毒理学会) 评价时间:2022-10-27

陈雯

中山大学公共卫生学院

副院长

综合评价

专家组认真审核了相关材料,听取了课题组的汇报,质询了有关项目情况,经认真讨论,形成验收意见如下: 一、项目组提供的资料齐全、规范,符合验收要求。 二、本研究模型训练完成后,为保证模型对语料具备较好的泛化能力,应从错误率、精度、准确率、精确度、召回率等方面进行评估。 三、项目完成了合同中规定的考核指标。 四、项目经费使用合理,符合相关要求。 验收专家组认为,该项目立题正确,设计科学,创新性强,资料可靠,结论可信;研究成果具有明显的原始和应用创新性及临床应用价值
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