一种医学临床微生物检测取样装置,包括收集管,所述收集管的下侧设置有套管,所述收集管的上端设置有连接台柱,所述连接台柱的前端设置有活动机构,所述活动机构包括轴杆、第一旋转块和第二旋转块,所述连接台柱的前后端贯穿设置有轴杆,所述轴杆的外表面靠近连接台柱的前侧设置有第一旋转块,所述轴杆的外表面靠近第一旋转块的前侧设置有第二旋转块,所述第二旋转块的后端设置有第一保护机构,所述第一保护机构包括第一保护壳、锁杆和第一弹簧。本实用新型结构小巧,使用方便简单,避免试管微生物在拿取过程中沾染其他物质或者细菌,而影响检测结果,更好的满足使用需要。