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脱毒技术是生产无毒苗的核心技术，传统的脱毒技术包括茎尖培养、热处理、热处理结合茎尖培养和微型嫁接等。茎尖培养对茎尖大小要求十分严格，茎尖过大难以脱毒；而茎尖过小则难以再生成完整植株，该项目主要的创新点在于：1.脱毒率高，并且可脱除许多顽固型病毒如：苹果锈果病、苹果茎沟病毒、马铃薯S病毒等；2.脱毒率不受茎尖大小的影响（可用2-3 毫米的茎尖，材料使用范围相比传统技术扩大10-20倍）；3.脱毒苗生产成本相比于传统方法低50%；4.茎尖超低温处理可同时实现脱毒与种质资源长期保存的双重目标。该技术已成功地用于脱除李、香蕉、葡萄、草莓、苹果和树莓等果树的多种病毒以及马铃薯等粮食作物和百合、菊花等花卉植物。目前该项目所用技术累计发表SCI论文105篇，申请国家发明专利2项，制定国家标准一项，地方标准一项。