储粮虫螨线粒体基因组鉴定分析系统
发布时间: 2021-11-17
来源: 科技服务团
基本信息
一、成果来源
项目成果来源于国家粮食和物资储备局科学研究院自主选题(ZX1917)
二、成果简介
本研究以粮库中26种主要害虫/螨类为研究对象,搭建了储粮害虫线粒体基因组研究技术体系,获取了26种主要储粮虫螨线粒体基因组序列,同时为一步提升基于线粒体基因的我国储粮害虫快速、准确鉴定能力,研制了储粮虫螨线粒体基因鉴定分析系统 (Stored grain insects mitochondrial gene identification and analysis system,SIMIAS)。,该系统主要功能包括:存储、比对、查询、虫螨形态信息库等功能,目前收集了我国26种储粮昆虫及仓储螨类的基础信息和线粒体基因组序列信息,提供了基于线粒体基因片段的相似度比对鉴定功能和系统发育树分析鉴定功能、基础信息查询及管理功能。初步应用效果显示,该系统界面友好、功能稳定,能够实现我国常见储粮害虫的快速、准确鉴定以及基于储粮虫螨线粒体相关的遗传差异比对分析。
SIMIAS系统把我国常见的储粮害虫线粒体基因组信息都录入到系统数据库中,当对某新的储粮虫螨进行鉴定时,只需把其任意线粒体基因片段和本系统中已经录入数据库的线粒体基因组进行序列比对或者统一构建发育树,可实时、快速的鉴定出该新的条形码是什么物种。还可采用构建系统发育树进行鉴定。点击鉴定结果物种名称的链接,可浏览物种的详细信息,包括中文名、英文名。
三、知识产权和成果成熟度
成果获得了“储粮害虫线粒体基因鉴定分析系统”[简称:GPMIAS]V1.0软件著作权登记证书一项。