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新品种是农业增产的“芯片”，非常重要。但是，持续100多年的小麦常规育种方法，仅靠表型选择，不能直接跟踪基因传递，导致了育种盲目性大、效率低，周期长，单产徘徊，品质不高。针对上述的技术瓶径，在国家“973”和多项国家自然科学基金的支持下，技术发明人将专利群（9项）技术综合用于常规育种全程的各个阶段，形成并实施了“贯穿小麦育种全程的多位点高效分子标记育种技术”大大提高了育种效率。

相对于目前已公开或授权的其它分子标记育种技术，该先导技术有突出的创造性和实用性：（1）本技术不是对某一个性状的标记及其单个标记的发明，而是与小麦常规育种全过程结合的多位点分子标记辅助选择方法，其第一个关键词“全过程”指在常规育种的各个阶段，即从种质资源鉴定、亲本选择、分离世代选育到形成品种的常规育种全程，均利用分子标记跟踪选择，是一套具体的、系统的小麦分子标记辅助育种技术，国内外至今没有查到类似发明专利。（2）第二个关键词“多位点”指根据常规育种不能同时对多个表型性状选择的难点，采用一个性状的多个标记或多个性状的多个标记进行选择，例如：用3个标记位点对抗白粉病进行了有效选择，用13个标记位点对7个性状进行了有效选择，这与大多数用一个性状的标记进行选择有明显的创新性。（3） 本发明在分子标记辅助育种中引用了常规育种的“重点株系群”和“一般株系群”的概念，两类株系群采取不同的分子标记处理，重点株系群体 “先分子标记后表现型选择”，而一般株系群体“先表现型选择后分子标记”，对表现型不好的株系不再进行标记。这种即高效选择又减少标记工作量的做法是发明人通过多年实践经验总结所得。（4）本发明专利在分子标记辅助育种中根据常规育种中性状的稳定程度差异，在不同的世代标记选择不同的性状。例如，抗病和粒重等性状稳定较快，在F2-F3世代用分子标记进行重点选择。小麦的穗粒数和单位面积穗数稳定较慢，则在F4-F5高世代进行选择。不同世代分子标记不同的性状，同样是发明人通过多年实践经验总结所得。

上述重要技术点，大大提高了分子标记育种的“可行性”、“有效性”和“高效性”，实现了“常规育种”和“分子标记育种”的真正结合。相比同规模的常规育种，该专利技术可使杂交组合减少50%、F1保留比例减少30%、F2种植面积减少50%、 F3-F4代选留株系减少60%、育种年限缩短2年、育种效率提高50%。