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本发明属于生物技术领域，具体涉及一种利用离子液体制备多糖微球的方法。本发明的方法，包括以下步骤(1)溶解多糖制成多糖溶液作为水相，使用疏水性离子液体溶解油溶性乳化剂作为油相；其中，所述油相与水相的体积比为11‑101，所述多糖水溶液浓度为0.1wt％‑20wt％，所述油溶性乳化剂质量为水相体积的0.1％‑2％g/mL；(2)将水相倒入油相，乳化形成油包水型乳滴；固化油包水型乳滴，制得多糖微球。本发明以离子液体代替有机溶剂，较好的避免了常规制备方法中需要使用大量挥发性有机溶剂的弊端，具有绿色环保的优势，制备出的微球具有良好的形貌和粒径等性质，可在生物技术及相关领域用作分离介质、细胞微载体等。