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本发明公开了一种生物炭负载复合酸洗沉降一体化生物淋滤设备及其方法，由反应器与储蓄池构成。反应器内安装隔板、兜网、旋流曝气头。储蓄池与反应器之间由斜板相连，并在其中安装活动隔板。本发明可应用于底泥中重金属的生物淋滤，淋滤运行阶段可利用旋流曝气头曝气时所产生的旋流形成液相体系的循环流动，且在兜网内包有生物质炭颗粒或其他微生物附着物以实现微生物的附着生长。淋滤结束所产生的淋滤酸液流至储蓄池内用于下一轮淋滤底泥的酸洗预处理。本发明复合微生物负载、旋流曝气及预酸化处理手段，大幅减短淋滤所需时间，解决淋滤酸液pH过低需要二次处理问题，且整体装置构建简单，运行稳定，是一种投入成本低，运行效率高的生物淋滤反应器。